Este libro plantea una distinción fundamental entre la Iglesia y la institución eclesiástica. A partir de esta distinción, cuestiona una estructura que, en lugar de conducir al alma directamente a Dios, puede llegar a ocupar el lugar de Dios en la conciencia del ser humano, limitando su libertad. Según el texto, la Institución no es simplemente una estructura humana de organización religiosa, sino la manifestación de un espíritu que pretende ocupar el lugar de Dios en la conciencia de las almas, usurpando su libertad y su capacidad de decidir ante Dios.